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试管婴儿的宫外孕原因主要诱发宫外孕的因素是女性因有不足的或缺损的输卵管结构，当受孕卵通过输卵管达到子宫时，因为输卵管闭合不严密或受孕卵自身活力不足，使得受精卵不可穿过管壁，着床于子宫内壁而不能解落于子宫内，使受精卵在输卵管上流浪，导致输卵管外孕，因此输卵管不足就是最主要宫外孕原因。再者某些慢性病，如多囊卵巢综合征和慢性卵巢炎，以及有些炎症性疾患也可能导致输卵管内不易贴合，当受孕卵通过输卵管而不可贴合子宫时，也会发生宫外孕。而免疫因素也是异位妊娠的主要原因。受精卵进入子宫后，会有一种免疫反响出现，若病患抗蛋白质尤其性抗体太高，免疫系统便会免疫受精卵，使受精卵不能正常受孕和着床，亦会出现宫外孕。另外各别女性闭经后子宫萎缩亦会导致受孕卵在输卵管上漂流，引起宫外孕。
试管婴儿的异位妊娠原因主要有以下几种：
1、移植异样：植入异样是指受孕卵在植入子宫壁前掉入阴道内或腹腔体内，导致移植失败，被称为宫外孕。
二、子宫内膜及残剩性宫外孕：子宫内膜及残剩性宫外孕是指受精卵抵达子宫内膜，子宫内膜缺乏充足的保养层，进而植入失败，亦可能导致异位妊娠的发生。
3、子宫病变：子宫病变可以分为炎症性宫病和非炎症性宫病。其中炎症宫外孕的产生率比较高，因为炎症宫外孕会影响受精卵的植入。
4、输卵管病变：输卵管病变是指输卵管出现变迁，从而导致受孕卵受侵犯、无法十足实时到达子宫，从而引发受孕卵的移植失败，也可能导致宫外孕产生。
⑸腹腔手术合并症：腹腔手术后，病人可能因为手术导致子宫内膜松弛，导致受孕卵的安定植入，发生异位妊娠的可能性会增大。
事实上异位妊娠的发生有许多种原因，所以试管婴儿的宫外孕缘故可能复杂。因此可以看到，术前检查精确诊断是预防异位妊娠发生的主要手段。针对不同异位妊娠原因有所区别的治疗方案，应根据病患的实质情况订定治疗方案。
